Но Николай, на чистой установке: clip2net.com/s/39PfUUf критично ли это?
Нет, это не критично. Просто там в самом конце установки выводится информация сколько времени затратилось, использовался метод $modx->getMicroTime(), который в итоге удалили. Я потом тоже это поправлю (судя по всему в пакете Vapor).
Не понятно какие именно изменения…
Скачайте и просто затрите вот эти три папки:
github.com/Fi1osof/ShopModxBox/tree/master/core/components/basket
github.com/Fi1osof/ShopModxBox/tree/master/core/components/shopmodxgroupedit
github.com/Fi1osof/ShopModxBox/tree/master/manager/components
Очистите кеш браузера и все должно заработать.