ну есть процессор register.class.php
ну и как я понял если зарегистрироваться через него то «из коробки» отправить сообщение с ссылкой на активацию нельзя.
активировать можно только через админку.
Было бы лучше, если бы вы ссылку на гит прислали. И вообще более конкретно рассказали что вам нужно и зачем. А то можно-то оно все можно. А вопрос «на сколько это будет родная функция» не шибко принципиальный.